拉丁學名：Bacillus natto
形態特征：納豆芽孢桿菌通常為（0.7-0.8)µm×(2.0-3.0)µm, 革蘭、氏陽性。生長在葡萄糖瓊脂的細胞原生質染色均勻。芽孢橢圓形或柱狀，中生或偏中生，即使孢囊膨大，也不顯著，有鞭毛，能運動。生長溫度高位45-55℃，低為5-20℃。孢子耐熱性強。
生態習性：納豆芽孢桿菌是從納豆制品中或從自然界的稻、谷上面分離得到。日本傳統的做法是把煮熟的大豆趁熱裝在用稻草做成的器皿里，利用稻草上附著的納豆菌自然發酵而做成的。用這種方法做成的納豆中，除了納豆菌以外，還含有其他雜菌，不僅衛生不過關，而且質量也不好。
孢子型納豆菌是具有耐酸、耐熱特性的有益菌,在胃酸下四小時活率為100,同時具有病原菌抑制能力,是各種益菌當中,對環境耐受力好可以直達小腸的菌種之一,口服后可改變人體腸道菌叢生態,幫消化道機能正?；?以使排便順暢,維持體內生理環保?？梢援a酸，增強動物細胞免疫放應。并能生成多種蛋白 酶（特別是堿性蛋白 酶）、糖化酶、脂肪酶、淀粉 酶，降解植物性飼料種某些復雜的碳水化合物，從而提高飼料的轉化率。
經濟價值：利用納豆菌可以制造納豆。因納豆菌是嗜氧菌,接觸空氣是很重要的。納豆菌在通過吞噬大豆蛋白來繁殖的時候,產生出的無數酵素納豆激酶和維生素K,具有的藥效,可以治三高（高血糖，高血壓，高血脂）和溶解血栓的作用，而且還能產生出氨基酸的美味。幾十年來，隨著納豆的有益健康的功能不斷被發現，納豆在日本不斷掀起”納豆熱潮"。
近年來，納豆芽孢桿菌開始用于飼料添加中。
